Током своје каријере издао је 62 албума, а од 1994. године његова породица је преко "Јуниверсал мјузика" објавила још 49 Запних албума, пренео је "Варајети".
Запа је музиком почео да се бави у средњој школи, а у јуну 1996. године је са својим бендом "Mothers оf Invention" објавио дебитантски албум "Freak Out!" ("Откини!", прим. прев), али у време када је издат није био ни критички ни комерцијално успешан.
Међутим, албум је 1999. године добио Греми награду за "Кућу славних", а 2003. године се нашао на листи магазина "Ролинг стон" међу 500 најбољих рок албума свих времена.
Своја два најуспешнија албума објавио је 1979. године - "Шеик Јербути" (енгл. "Sheikh Yerbouti") и "Џоова гаража" (енгл. "Јое''s garage"), који је у својој књизи из 2006. године "Речи и музика Френка Запе", Кели Фишер Лоу назвала "истинским ремек делом".
Магазин "Ролинг стоун" Запу је 2004. године ставио на 71. место 100 најбољих уметника свих времена.
Магазин је 2011. године издао листу 100 најбољих гитариста свих времена, на којој се Запа нашао на 22. месту.
Запа је био, како наводи италијански сајт "Панорама", мајстор музичке субверзије који је сматрао да се музика Стравинског може мешати са јодловањем, "ду-воп" групама, џезом, буком унутар оквира рока.
Славни музичар се последњи пут појавио на бини у септембру 1992. годину у Франкфурту, изводећи свој, како наводи "Панорама" најамбициознији и визионарски албум "Жута ајкула" (енгл. "The Yellow Shark").
Запа је након тешке битке са раком простате преминуо 4. децембра 1993. године у 52. години, само 17 дана пре свог 53. рођендана.
